Координационным советом по внедрению ERP систем в АО «НК «КазМунайГаз» после успешного внедрения автоматизированной системы управления на базе решений немецкой компании SAP AG в АО «КазТрансОйл» было принято решение о расширении сферы деятельности и создании консалтинговой компании, занимающейся аутсорсингом ERP систем на предприятиях нефтегазовой отрасли Казахстана.
В связи с этим в марте 2005 года был создан филиал АО «KazTransCom» - «IT-Service».
В августе 2006 года филиал «IT-service» был преобразован в ТОО «ERP-Service «KazTransCom» и зарегистрирован в Департаменте юстиции г. Астаны в ноябре 2006 года на базе ТОО «EРП-сервис», самостоятельно действующем с апреля 2004 года и приобретенного АО «KazTransCom» с целью создания дочерней компании.
С мая 2017 года ТОО «ERP-Service «KazTransCom» сменило наименование на ТОО «ERP-Service».